Влияние генетики на коронавирус
Генетика и коронавирус
Кто вероятнее всего заболеет коронавирусом, а кто- нет. Об этом задумывался каждый из нас. И вот ученые выявили генетическую предрасположенность к тяжелой форме COVID-19.
Ключевой механизм, используемых человеческим организмом для борьбы с вирусными инфекциями – Т-клеточный иммунитет. В его основе лежит процесс обнаружения вирусных пептидов на поверхности клеток, зараженных инфекцией.
За этими клетками следует активация Т-лимфоцитов, способных отторгать вирус.
За показ вируса в клетках человека отвечают молекулы человеческого лейкоцитарного антигена класса I (HLA-I). Код из шести молекул уникален для каждого человека и передается по наследству, следовательно обнаружение вирусных пептид обусловлено генетикой.
Индивидуальные комбинации рецепторов HLA класса I существенно влияют на тяжесть многих инфекционных заболеваний, в том числе малярия, туберкулез, ВИЧ и вирусный гепатит.
Информация о взаимосвязи генотипа HLA класса I и тяжести заболевания COVID-19, вызванного SARS-CoV-2, минимальная.
То есть, если вирус хорошо обнаруживается, то иммунные клетки быстро находят его и уничтожают. Ежели набор генов плохо справляется с обнаружением вирусов, то велика вероятность тяжелых последствий заболевания.
Как шло исследование?
В Городскую клиническую больницу им. О. М. Филатова поступили 111 пациентов, зараженных COVID-19, которые умерли в период с мая по июль 2020 года, при этом все пациенты имели один положительный тест на SARS-CoV-2.
Среди них часть имела хронические заболевания и лечилась дополнительной иммуностимуляцией – они не были взяты в исследование.
Больных разделили на две группы – моложе 60 лет и старше. Кровь собирали после смерти – из правого желудочка.
Ученые из НИУ ВШЭ и специалистами медицинского университета имени Н. И. Пирогова и московской Городской клинической больницы № 15 имени О. М. Филатова исследовали взаимосвязь между генотипом HLA-I и тяжестью COVID-19.
Для построения модели они использовали машинное обучение.
Гипотеза строилась на предположении, если набор аллелей HLA-I позволяет качественно показывать пептиды вируса SARS-CoV-2, то риски развития тяжелой стадии COVID-19 будут минимальными и наоборот – чем больше вирусных пептидов с высоким сродством связывается с HLA I класса, тем легче протекает заболевание.
С целью изучения модели, специалисты проанализировали генотипы более 100 больных, перенесших коронавирус, и свыше 400 — здоровых пациентов всех участников эксперимента.
С помощью модели возможно выявить группы людей, у которых заражение новыми штаммами SARS-CoV-2 способно привести к более тяжелым формам заболевания.
Среди участников исследования были пациенты из Москвы, а также из Мадрида.
Прогнозы оценки рисков у пациентов, страдающих тяжелой формой COVID-19, была значительно выше, чем у больных ковидом средней или легкой стадией.
Gamalea ©
Источники: ria.ru , frontiersin.org
